Es gibt vier Materiahöhlen, die in der ganzen Welt versteckt sind. Man kann sie ohne weiteres nicht errerichen und braucht normalerweise einen speziellen Chocobo. In jeder Höhle findet man eine ganz besonders mächtige Materia. Auf unserer Weltkarte sind die Höhlen in lila/pink eingezeichnet und nach der Materia benannt, die dort zu finden ist.
Die Runde Insel
Ganz im Nordwesten der Weltkarte. Die Runde Insel ist ein ausgebrannter Vulkan, der heute von einem dichten Wald bewachsen ist. Die Highwind kann dort nicht landen, ein Goldener Chocobo ist darum Pflicht! Hier findet ihr die äußerst mächtige Aufrufmateria „Ritter der Runde“.
Nord Corel
Sie liegt nördlich von Corel hinter einem Fluss in den Bergen. Man braucht darum einen Schwarzen oder Goldenen Chocobo. Hier findet man die „HP <-> MP“-Materia, die es ermöglicht, HP mit den MP auszutauschen, also über bis zu 9999 MP zu verfügen, während im Gegenzug die HP auf das Maximum von 999 beschränkt werden (natürlich nur falls der Charakter auch 9999 HP und 999 MP hat; ansonsten mit den jeweiligen Werten).
Mideel
Östlich der Stadt Mideel findet sich diese Materiahöhle. Sie enthält die Materia „Quadra-Zauber“. Man benötigt einen Blauen, Schwarzen oder Goldenen Chocobo, um die Höhle zu erreichen.
Wutai
Diese Höhle befindet sich südwestlich der Stadt Wutai auf dem gleichnamigen Kontinent. Sie ist in den Bergen versteckt und nur mit einem Grünen, Schwarzen oder auch Goldenen Chocobo zu erreichen. Der Lohn der Mühen ist die kostbare Befehlsmateria „Nachahmen“.
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