Um die Philosophie hinter Final Fantasy VII zu erfassen, sollte man zumindest in den Grundzügen über die — tatsächlich existierende — Gaia-Theorie bescheid wissen, sowie verstanden haben, inwieweit diese dem Spiel abgewandelt zugrunde liegt.
Die Gaia-Theorie — man müsste eher von „Gaia-Hypothese“ sprechen — ist ein relativ neue Idee, welche Mitte der 1960er Jahre von der Biologin Lynn Margulist und dem Chemiker, Biophysiker und Mediziner James Lovelock entwickelt wurde und im Gegensatz zur bis dahin geläufigen Annahme steht, dass die Erde ein toter Felsklotz ist.
Die Gaia-Hypothese geht davon aus, dass die Erde ein Lebewesen, ein einziger großer Organismus ist, der sich genau die Umgebung schafft, die er braucht. Das Steuerungs- und Rückkopplungssystem, das für diese Aktivitäten zuständig ist, benannte Lovelock vor gut einem Jahrzehnt, angeregt von dem Vorschlag des Literaturnobelpreisträgers William Golding, nach der griechischen Erdgottheit Gaia.
Die Gaia-Theorie behauptet, daß die Evolution des Lebens nur aus der aktiven Kooperation der Sphären, der vier Grundelemente des Erdbodens (Lithosphäre), des Wassers (Hydrosphäre), der Luft (Atmosphäre) und des Lebens (Biosphäre) erklärbar ist. Nach Lovelocks Gaia-Theorie sind die etwa vier Milliarden Lebensarten auf unserem Planeten durch Koevolution und Rückkopplung derart koordiniert, daß der gesamte Planet ein sich selbstorganisierendes System darstellt. In einfacheren Worten bedeutet dies: So wie ein Mensch oder ein Tier aus kleineren Organismen besteht (rote und weiße Blutkörperchen, Zellen oder Bakterien und ähnliches), ohne die er nicht leben kann, sind Menschen und Tiere ihrerseits Teil eines größeren Lebewesens, nämlich der Erde.
Glaubt man der Gaia-Theorie, so ist der Mensch natürlich nicht mehr der Herr der Natur, sondern nur ein Teil des Gesamten, der sich anpassen muss oder andernfalls vernichtet wird — in der Welt von Final Fantasy VII stellt dies eine ganz reale Bedrohung dar.
Diese Gedanken sind immer wieder von der Wissenschaft belächelt und kritisiert worden. Nicht zuletzt, weil die Gaia-Hypothese entscheidenen Einfluss auf die Hippie- und New Age-Bewegung hatte und zu einer Art Mythos und Pseudo-Religion erhoben wurde. Davon distanzierten sich die Schöpfer dieser Hypothese, so sagte Lovelock einmal:
Aber wenn ich von einem lebendigen Planeten spreche, soll das keinen animistischen Beiklang haben [Anmerkung: Gemeint ist, dass die Erde als Göttin betrachtet werden soll]; ich denke nicht an eine empfindungsfähige Erde oder an Steine, die sich nach eigenem Willen und eigener Zielsetzung bewegen. Ich denke mir alles, was die Erde tun mag, etwa die Klimasteuerung, als automatisch, nicht als Willensakt; vor allem denke ich mir nichts davon als außerhalb der strengen Grenzen der Naturwissenschaften ablaufend. Ich achte die Haltung derer, die Trost in der Kirche finden und ihre Gebete sprechen, zugleich aber einräumen, daß die Logik allein keine überzeugenden Gründe für den Glauben an Gott liefert. In gleicher Weise achte ich die Haltung jener, die Trost in der Natur finden und ihre Gebete vielleicht zu Gaia sprechen möchten.
Lovelock meint also, dass man die Erde als Lebewesen ansehen kann, nicht in dem Sinne, dass sie eine Seele hat und bewusste Entscheidungen trifft, sondern im systemtheoretischen Verständnis, wonach sie ein System darstellt, welches sich als Gesamtheit organisieren und verändern kann.
Wie Verteidiger der Gaia-Hypothese weiterhin gerne sagen, beruht der Spott ihrer Kritiker vor allem auf der Angst, sich von dem bestehenden Weltbild zu lösen und Ideen zu akzeptieren, die als „veraltet“ und „primitiv“ angesehen werden. Kulte, die der Verehrung von Natur und Erde galten, fanden sich tatsächlich in vielen frühen menschlichen Kulturen, sei es bei Germanen, Griechen oder Indios. Naturvölker praktzieren ähnliche Kulte noch heute. Die Gaia-Hypothese ist ein Ansatz, eine wissenschaftliche Bestätigung dafür zu suchen.
Egal ob man nun der Gaia-Hypothese Beachtung schenkt oder sie als totalen Schwachsinn abtut: Wichtig ist festzuhalten, dass die Gaia-Hypothese in der Welt Final Fantasy VII wahr ist. Mehr noch: Es wird von einem Planeten ausgegangen, der tatsächlich ein denkendes und fühlendes Lebewesen mit einer Seele ist. Dies widerspricht der wissenschaftlichen Gaia-Hypothese, es ist ein reines Phantasieprodukt von Squaresoft, basierend auf der wissenschaftlichen Idee.